Ocupações irregulares, descarga de dejetos domiciliares e a eliminação da vegetação nativa são alguns dos fatores que estão contribuindo para o aumento do assoreamento do complexo lagunar Mundaú/Manguaba, que segundo o Instituto do Meio Ambiente (IMA) vem se agravando nos últimos anos.
Segundo o IMA, é necessário que haja o engajamento dos municípios banhados pelas lagoas para resolver o problema. Ações paliativas como a dragagem (aprofundamento e/ou remoção de solo, entulhos do fundo da lagoa, por meio de equipamento denominado "draga") retardam os impactos, mas não resolvem a situação.
De acordo com técnicos do IMA, o processo principalmente pela falta de saneamento e infraestrutura nas comunidades que vivem no entorno. O Instituto vem cobrando providencias dos gestores municipais para realizar programas de educação ambiental para as pessoas que vivem nas comunidades à beira das lagoas e estudantes de todo estado.
Essas lagoas são consideradas verdadeiras “maternidades” da vida marinha, ecossistemas perfeitos para a desova, nascimento e crescimento de espécies que encontram um habitat de refúgio para se proteger dos predadores do mar. Com o aumento da poluição nessas águas, a biodiversidade lagunar está diminuindo
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